特定のorganismの全てのuser annotationを除去する
Apollo-2.4.1/docs/web_services/examples/groovy
などに移動して
groovy ./delete_annotations_from_organism.groovy \
-organismname "Organismname" \
-destinationurl http://localhost:8080/apollo-2.4.1 \
-adminusername admin@mail.hoge \
-adminpassword password
gff3ファイルの中身を全てuser annotationに入れる
Apollo-2.4.1
に移動して
perl ./tools/data/add_features_from_gff3_to_annotations.pl \
-U localhost:8080/apollo-2.4.1 \
-u admin@mail.hoge \
-p password \
-i /match.gff3 \
-t match \
-e match_sub \
-o "Organismname" -X