タイトルそのまんまです。Mac版UnityEditorでiOSの"Build and Run"をすると、この"Building Player - Build & Install iPhone player"というウィンドウが出てXcodeが起動するんですが、その後もこのウィンドウが閉じられず、"command + option + esc"でアプリを終了するしかなくなってしまいます…。
当然作業にならないし、情報も全くないので自分の環境だけかと思っていたんですが、見つけました。
Unity 5 “Build & Install iPhone player” dialog does not disappear
http://stackoverflow.com/questions/40038344/unity-5-build-install-iphone-player-dialog-does-not-disappear
どうやら、Unityのバージョン5.4.1f1(と5.4.1p1?)でのみ発生するようで、5.4.2f2に更新したら直りました。ほっ。
リリースノートにも書いてありました。Xcode8との相性問題だったようです。他にもiOS10やiPhone7に関する更新があるようで、iOS版をビルドする場合は5.4.2にした方が良さそうです。
iOS: Update Build and Run to work with Xcode 8.
https://unity3d.com/jp/unity/whats-new/unity-5.4.2