R事始め: インストール

研究のために新たにRをUbuntu20.04に導入したので、その備忘録。
Rは初心者なので、簡単な勉強記録もつける。

事前準備

いくつかのRパッケージは、blas, lapackなどの線形代数パッケージを利用するので、事前にそれを入れておく。

$ sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev

R インストール

日本のミラーサイトの１つは以下のもの：
https://cran.ism.ac.jp/

ここから、OSに合わせてダウンロードを行う。
.>> Download for Linux >> ubuntu >>

# update indices
$ sudo apt update -qq

# install two helper packages we need
$ sudo apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr

# import the signing key (by Michael Rutter) for these repo
$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

# add the R 4.0 repo from CRAN -- adjust 'focal' to 'groovy' or 'bionic' as needed
$ sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"

# ここからRをインストール
$ sudo apt install --no-install-recommends r-base

# ここで関連パッケージなどをインストールする（らしい）
$ sudo add-apt-repository ppa:c2d4u.team/c2d4u4.0+

Rstudio

Rを動かすだけなら、以上の設定だけでOKである。
GUIを使うために、さらにRstudioを入れる。

　https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download
. >> Ubuntu 18/Debian 10 [Ubuntu 20.04は明示的には書かれていない]
. >> rstudio-1.4.1106-amd64.deb をダウンロード。

$ sudo apt update
$ sudo apt -y install r-base gdebi-core
$ sudo gdebi rstudio-1.4.1106-amd64.deb

これでインストールは完了。

$ rstudio

このコマンドで起動できる。

参考・出典
https://linuxconfig.org/how-to-install-rstudio-on-ubuntu-20-04-focal-fossa-linux

環境について。

# 今の作業ディレクトリを表示
> getwd()

#　作業ディレクトリを指定して移動
> setwd('/Users/myname/sandbox/projectA')

パッケージの読み込みなど

> require(MASS)
Loading required package: MASS