システム権限 >除外ユーザの多要素認証を放棄 を有効化した権限セットを作って、この権限セットを以下の方法で一括割り当てする方法もあると思います。
https://sf.forum.circlace.com/articles/782615326377381888
データローダを使用して権限セットを一括で割り当てる
https://help.salesforce.com/s/articleView?id=000384595&type=1
以下に興味深い情報
プロファイルのシステム権限関係はProfileオブジェクトではなく、PermissionSetオブジェクトで管理されています。
エクスポートは出来たのですが、PermissionSetオブジェクトに対し、Updateしようとしたところ「You can’t create, edit, or delete this permission set because it's associated with a profile.」というエラーが出てしまいました…