設定上では無効になっているリードソース「Google Natural Search」等が勝手にリード情報に入ってしまうのだが、どうしたら防げるか。

下記のような自分で設定した覚えのないリードソースが入力されるケースが散見されます。

Google Natural Search
Bing Natural Search
Google Ad
corporate

Account Engagement が自動的にセットしていると思います。

プロスペクトのソース項目の値は、参照元 URL によって決まります。参照元 URL は、トラッキングコードが含まれるページを初めて訪問したビジターが、その直前に訪問していたページです。参照元 URL が存在するとき、Account Engagement はソースデータを引き出して、特定のベンダーの予想される Web サイトと照合します。

たとえばプロスペクトの参照元 URL が「www.linkedin.com/profile/SarahPersons」で、UTM パラメーターが存在しない場合、プロスペクトのソース項目は「LinkedIn」です。

https://help.salesforce.com/s/articleView?id=sf.pardot_how_source_field_populated.htm&type=5

Salesforceのリードソース項目にレコードトリガーフローを設定してGoogle Natural Searchならコーポレートサイトに変更するくらいしか思いつきませんね。うまく設定したらAccount Engagementにも同じように同期できるのではないでしょうか。