一定時間以上経過したら強制的にコマンドを終了させるには、以下のようにします。

$timeoutSeconds = 5    #タイムアウトの秒数

$j = Start-Job {
    #ここに時間がかかりそうなコマンドを記述する
    Get-ChildItem *
}

Wait-Job -Job $j -Timeout $timeoutSeconds | Out-Null

if($j.State -eq "Completed"){
    "完了！"
    Receive-Job $j    #結果を出力する
}elseif($j.State -eq "Running"){
    "中断"
}elseif($j.State -eq "Failed"){
    "例外発生"
}

Remove-Job -force $j    #cleanup

参考

[PowerShell]Start-Jobで共通の関数を使う
 [PowerShell]Start-Jobのスクリプトブロックでの例外を取得する

[PowerShell]コマンドの実行にタイムアウトを設定する

参考

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