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Python Library メモ

Last updated at Posted at 2020-01-09

Oil and Gas Subsurface

obspy

Seismic data の読み書き、編集
https://github.com/obspy/obspy/wiki

bruge

Geophysics tool (signal processing, rock physics, forward modeling, etc.)
https://github.com/agile-geoscience/bruges

lasio

Las file の読み書き、編集
https://lasio.readthedocs.io/en/latest/

welly

Well log の読み書き、編集、表示
https://github.com/agile-geoscience/welly

pint

単位変換
https://pint.readthedocs.io/en/0.10.1/

Machine Learning / Deep Learning

TensorFlow

scikit-learn

Keras

XGBoost

Shallow Learningで使用
https://xgboost.readthedocs.io/en/latest/

LightGBM

Shallow Learningで使用、文字通りXGBoostよりも計算負荷が軽い。
https://lightgbm.readthedocs.io/en/latest/

umap-learn

次元削減で使用。
https://pypi.org/project/umap-learn/

HDBSCAN (Hierarchical Density-Based Spatial Clustering and Applications with Noise)

クラスタリングに使用。
https://pypi.org/project/hdbscan/

Natural Language Processing

PyPDF2

ヘッダー情報等を含むPDFファイルをテキストファイルとして変換する際に使用。
https://pypi.org/project/PyPDF2/

nltk

言語処理の前処理に使用。また、word2vecをロードする際にも使用。
https://www.nltk.org/index.html

gensim

Topic modelling, document indexing and similarity retrieval with large corpora
https://pypi.org/project/gensim/

wordcloud

Visualize words with different sizes depending on its importance
https://pypi.org/project/wordcloud/

GIS

GeoPandas

シェープファイル、Geojson等の地理データの読み書き、ポリゴンの作成等に使用。
http://geopandas.org/

descartes

GeoPandasを使ってポリゴンを描画するためのライブラリ
https://pypi.org/project/descartes/

mapclassify

GeoPandas上でカラーマップを描画するためのライブラリ
https://pypi.org/project/mapclassify/

cenpy

アメリカの国勢調査APIを使用するためのライブラリ
https://github.com/cenpy-devs/cenpy

Fiona

Visualization via interactive Leaflet maps
https://github.com/python-visualization/folium

bokeh

Interactive visualization library browsers
https://github.com/bokeh

Rasterio

Read Raster files
https://rasterio.readthedocs.io/en/latest/

PySAL

Spatial data analysis
http://pysal.org

PyShp
The Python Shapefile Library (PyShp) reads and writes ESRI Shapefiles in pure Python.
https://github.com/GeospatialPython/pyshp

Utility

tqdm

For loopの経過をプロセスバーで表示。
https://github.com/tqdm/tqdm

keras_tqdm

Kerasのモデルトレーニングの際に、バッチとエポックの経過をプロセスバーで表示。
https://github.com/bstriner/keras-tqdm

cupy

GPUを使った並列計算用のライブラリ、C++の知識が必要。
https://github.com/cupy/cupy

PyCUDA

GPUを使った並列計算用のライブラリ、C++の知識が必要。
https://documen.tician.de/pycuda/

Plotly-express

インタラクティブにプロットするためのライブラリ。
https://plot.ly/python/plotly-express/

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