個人用メモ．なので一部表現があいまいです

javaファイルとclassファイルを別々のディレクトリにまとめたい

カレントディレクトリにて

javac -d <class directory> <src directory>/<java file>

class directory : classファイルを置きたいディレクトリ
src directory : コンパイルしたいファイルがあるディレクトリ
java file : コンパイルしたいファイル

【補足】
・クラスファイルの出力先ディレクトリを設定
・そのディレクトリはすでに存在している必要がある

【例】
例えば，カレントディレクトリにsrc，classのディレクトリがあり，src内に
Foo.java, Bazz.javaがあるとき，src内のjavaファイルをコンパイルしたい

javac -d class src/Foo.java src/Bazz.java

もしくは

javac -d class src/*.java

によって class に Foo.class, Bazz.class ができる

ディレクトリ内のファイルの実行

カレントディレクトリにて

java -cp <class directory>/<class file>

class directory : コンパイルされたファイルがあるディレクトリ
java file : コンパイルされたファイル

【補足】
・クラスファイルを検索するディレクトリのリストを指定
・cpは，classpathの略　

【例】
カレントディレクトリにclassディレクトリがあり，そこにFoo.classがある場合

java -cp class Foo

拡張子はもちろん要りません．