JupyterLabをアップデートしたところ、拡張機能のアップデートを求められたので言われるままそうしたところjupyterlab-gitが左のメニューバーから消えた。
jupyterlab-gitのGitHubのTroubleshootingに書いてある通りに
$ jupyter serverextension list
$ jupyter labextension list
を実行すると、こちらの記事と同じエラーが発生していたため、バグの元になっているjsonファイルを消去。
さらに、serverextensionとlabextensionのversionは同じでないといけないのですが、現在labextensionのv0.21.0が出ているようで、JupyterLab上でlabextensionをインストールするとserverextensionの最新版v0.20.0とバージョンが異なる状況になってしまいます。
そこで
$ jupyter labextension uninstall @jupyterlab/git
$ jupyter labextension install @jupyterlab/git@0.20.0
としてバージョンを揃えてあげて再ビルドしたところ直りました。
疲れた……