disk_total_spaceとdisk_free_space関数が使える場合は簡単に計算できます。

bytes_check.php

<?php
$si_prefix = array('B', 'KB', 'MB', 'GB', 'TB', 'EB', 'ZB', 'YB');
$base = 1024;
$path = '/';

$total_bytes = disk_total_space($path);//全体サイズ
$free_bytes = disk_free_space($path);//空き容量

$used_bytes = $total_bytes - $free_bytes;
$class = min((int)log($used_bytes, $base), count($si_prefix) - 1);
echo '使用容量:'.sprintf('%1.2f', $used_bytes / pow($base,$class)).$si_prefix[$class];

##レンタルサーバーの場合
サーバーがレンタルサーバーなどの場合はdisk_total_spaceで正しい数値がでないため
下記のように直接ファイルサイズを足していきます。

bytes_check.php

<?php
//使用容量の数値（バイト）
function dir_size($dir) {
  $handle = opendir($dir);
  while ($file = readdir($handle)) {
    if ($file != '..' && $file != '.' && !is_dir($dir.'/'.$file)) {
      $mas += filesize($dir.'/'.$file);
    } else if (is_dir($dir.'/'.$file) && $file != '..' && $file != '.') {
      $mas += dir_size($dir.'/'.$file);
    }
  }
  return $mas;
}

//数値の単位を変更
function used_bytes($dir){
  $si_prefix = array('B', 'KB', 'MB', 'GB', 'TB', 'EB', 'ZB', 'YB');
  $base = 1024;
  $dir_size = dir_size($dir);
  $class = min((int)log($dir_size, $base), count($si_prefix) - 1);
  $used_bytes = sprintf('%1.2f', $dir_size / pow($base,$class)).$si_prefix[$class];
  return $used_bytes;
}
echo "使用容量:".used_bytes(dirname(__FILE__));

used_bytes($dir)で出力します。
$dirには絶対パスを指定してください。