STS 3.9.0をダウンロードしてセットアップすると、いつものCtrl + Shift + Oが効かなくて、あれ?となったのでメモを残しておきます。
まず、不具合でショートカットが使えない場合、Javaソース編集中このようになっています。
改善方法
[ウィンドウ]-[設定]-[一般]-[キー]のオプションを開きます。
フィルターというボタンを押します。すると下記のウィンドウが開くので
カテゴリーがないコマンドをフィルターのチェックを外す
カテゴリーがないコマンドが表示された状態で、検索エリアに "Go"と入力
これでCtrl + Shift + O インポートの編成ショートカットが使えるようになります!
参考
spring tool suite - Organize Imports shortcut not working after STS update - Stack Overflow