LaTeX→Qiita用MathJax変換マクロ@EmEditorはEmEditorでしか動かないのでブラウザで動くようにした．
変換結果は上記の記事とほぼ同じで，簡単な$\mathrm{\LaTeX}$文書しか変換できないが，
\label付の式に連番を自動割当するので作業が大幅に軽減されるはず．
Qiita用MathJaxマクロ集も含めた．

入力例

…Cauchyの積分定理より，
\begin{align}
\oint\D z f(z) = 2\pi\I\sum_{a}\Res_{z=a} f(z),\label{Cauchy}
\end{align}
である．ここで$f(z)$は
\begin{align}
f(z):=\cdots,\label{f}
\end{align}
%
%
で定義されている．\Ref{f}を\Ref{Cauchy}に代入すると…

↓LaTeX2MathJax.html (ヘッダなし変換)


…Cauchyの積分定理より，

```math
\begin{align}
\oint\D z f(z) = 2\pi\I\sum_{a}\Res_{z = a} f(z), \tag{1}\label{Cauchy}
\end{align}
```

である．ここで$f(z)$は

```math
\begin{align}
f(z): = \cdots, \tag{2}\label{f}
\end{align}
```

で定義されている．__($\ref{f}$)__を__($\ref{Cauchy}$)__に代入すると…

↓Qiita記事に貼り付け

…Cauchyの積分定理より，

\begin{align}
\oint\D z f(z) = 2\pi\I\sum_{a}\Res_{z = a} f(z), \tag{1}\label{Cauchy}
\end{align}

である．ここで$f(z)$は

\begin{align}
f(z): = \cdots, \tag{2}\label{f}
\end{align}

で定義されている．($\ref{f}$)を($\ref{Cauchy}$)に代入すると…

一部エラーが起きているが，ヘッダをつけて変換すれば完全に表示される．

変換器本体

以下をUTF-8でHTMLファイルとして保存してブラウザで開けばOK．

LaTeX2MathJax.html

<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
  <meta charset="utf-8"/>
  <title>LaTeX2MathJax</title>
</head>
<body>
  <form>
    <div>
    <font size=10>
    LaTeX→MathJax変換器（Qiita用）<br>
    </font>
    <div>
    <input type="button" onclick="paste()" value="ペースト">
    </div>
    <textarea placeholder="ここにLaTeXコマンドをペーストする"
    id="LaTeX" rows="20" cols="100" wrap="off"></textarea>
    </div>
    <div>
    ↓<input type="button" onclick="convert()" value="変換">
    数式環境：<input type="text" id="mathenv" value="equation align">
    <input type="checkbox" id ="header" checked> headerを付加する
    <input type="checkbox" id ="copy" checked> 変換結果をクリップボードにコピーする
    </div>
    <div>
    <textarea id="MathJax" rows="20" cols="100" wrap="off"></textarea>
    </div>
    <div>
    ヘッダ：
    </div>
    <div>
    <textarea id="headerbody" rows="20" cols="100" wrap="off">
$\phantom{}$$
\newcommand\nr{\notag\\\\}%タグなし改行用
\newcommand\ret{\notag\\\\&\qquad}%数式改行用
\newcommand\I{\mathrm{i}}
\newcommand\D{\mathrm{d}}
\newcommand\E{\mathrm{e}}
\newcommand\hc{\mathrm{h.c.}}
\newcommand\cc{\mathrm{c.c.}}
\newcommand\O[1]{\mathscr{O}\left(#1\right)}
\newcommand\abs[1]{{\left\rvert #1 \right\lvert}}
\newcommand\Res{\mathop{\mathrm{Res}}}
\newcommand\bra[1]{\mathinner{\langle{#1}|}}
\newcommand\ket[1]{\mathinner{|{#1}\rangle}}
\newcommand\braket[1]{\mathinner{\langle{#1}\rangle}}
\newcommand\Bra[1]{\left\langle#1\right|}
\newcommand\Ket[1]{\left|#1\right\rangle}
\newcommand\Braket[1]{\left\langle #1 \right\rangle}
\newcommand\|{\middle|}%\Braket用
\DeclareMathOperator{\Log}{Log}
\DeclareMathOperator{\Arg}{Arg}
\DeclareMathOperator{\sgn}{sgn}
\DeclareMathOperator{\Tr}{Tr}
\newcommand\dashint{\mathchoice
  {\int\kern-10pt-}
  {\int\kern-8.5pt-}
  {\int\kern-6.1pt-}
  {\int\kern-4.58pt-}}
\newcommand\set[1]{\left\\{#1\right\\}}
\newcommand\for[1]{\quad\mathrm{for}\quad #1}
\newcommand\LHS{\mathrm{(LHS)}}
\newcommand\RHS{\mathrm{(RHS)}}
$</textarea>
    </div>
  </form>

  <script language="javascript" type="text/javascript">

  function paste(){
    var pasteArea=document.getElementById("LaTeX");
    if(navigator.clipboard){
        navigator.clipboard.readText()
        .then(function(text){
            pasteArea.textContent = text;
        });
    }
  }

  function convert() {
    var env = document.getElementById("mathenv").value;
    env = env.replace(/\s+/g,"|");
    beginmath = new RegExp('\\\\begin\{('+env+')\}','g');
    endmath = new RegExp('\\\\end\{('+env+')\}','g');

    var headerbody=document.getElementById("headerbody").value;

    var str = document.getElementById("LaTeX").value;
    str = str.replace(/\%.*\n/g,"");
    str = str.replace(/\n{3,}/g,"\n\n");
    //
    str = str.replace(beginmath,"\n\n```math\n\\begin{$1}");
    str = str.replace(endmath,"\\end{$1}\n```\n\n");
    //
    str = str.replace(/\ *(<|>|=)\ */g,"\ $1\ ");
    //
    str = str.replace(/\\section\{(.*?)\}/g,"\n\n# $1\n\n");
    str = str.replace(/\\subsection\{(.*?)\}/g,"\n\n## $1\n\n");
    str = str.replace(/\\subsubsection\{(.*?)\}/g,"\n\n### $1\n\n");
    //
    str = str.replace(/\\tag\{.*?\}/g,"\ ");
    str = str.replace(/\\label/g,"\ \\tag\{\}\\label");
    str = str.replace(/\\ref\{(.*?)\}/gi,"__(\$\\ref\{$1\}\$)__");
    var n=(str.match(/\\tag\{\}/g)||[]).length;
    for (var i=1; i<=n ;++i){
        str=str.replace( /\\tag\{\}/, "\\tag\{"+i+"\}");
    }
    //
    str = str.replace(/\n{3,}/g,"\n\n");
    str = str.replace(/\ {2,}/g,"\ ");
    if(document.getElementById("header").checked){
        str = headerbody+"\n\n"+str;
    }
    document.getElementById("MathJax").innerHTML = str;

    if(document.getElementById("copy").checked){
        target = document.getElementById("MathJax")
        target.select();
        document.execCommand("copy");
        document.getSelection().empty(target);
    }
  }
  </script>
</body>
</html>

JavaScriptというものを初めて使った．とても便利でびっくり．

参考文献

David Flanagan (著)，村上列 (翻訳)「JavaScript 第6版」, オライリージャパン (2012)
David Flanagan (著)，木下哲也 (翻訳)「JavaScriptリファレンス第6版」，オライリージャパン (2012)
[JavaScript]クリップボードを使ったコピーとペースト
JSでクリップボードのコピー&ペーストを実装する2つの方法【execCommand / Clipboard API】
JavaScript テキストボックスの値を取得/設定する
JavaScript テキストエリアの値を取得/設定するサンプル
正規表現を使ったマッチングに変数を使用する