はじめに
biogemeを使い始めるまでの個人メモ．あまり日本語の情報，またbisonbiogemeの情報はないので記しておくことにした．
はっきり言って素人なので間違いに注意．
Biogemeとは
biogemeは離散選択モデルの最尤推定のためのソフトウェア．無料で利用可能．
pythonのパッケージとしても提供されているが，今回はGUIのBisonBiogemeを利用する．
導入
公式webサイトから入手可能．bisonbiogemeはArchivesにある．
最新版は不安定との噂(環境の問題かも？)で，version2.2を利用．
・ biogeme-2.2.tar.gz
・ biogeme-v22.zip
をダウンロード，解凍する．
以降，使用手順を記載するが，HPにあったdocumentにも使い方が解説されているので参照のこと．
サンプルデータ
ここにサンプルデータがアップされている．今回は上記のdocumentに従ってSwissmetroのデータを利用する．このファイルは.datで，Excel等で開くことができる．
examples
Archivesのversion2.3 examples-v23.zipにはサンプルとなるモデル.mod(インプット)と結果のhtml（アウトプット）がある．
差し当たりの利用には，これを参考にすればよいだろう．
起動と使い方の概要
まずはbiogeme-v22/Biogeme_windows/guibiogeme.exeを起動してみる．
起動画面はこんな感じ．
使い方としては，
- Model spec. fileにモデルとなる.modファイルを選択
- Data fileにデータファイルを選択
- Estimateでパラメータ推定
である．
非常にシンプル．なお，Simulateは推定したモデルを用いて推計するときに使う．
ちなみに，modファイルとdatファイルは同じディレクトリにないとダメっぽい．
Modファイルについて
上記サンプルモデル，01logit.modの中身を概説する．ここにコピペするわけにはいかないので各々で確認すること．
"//"はコメントアウトである．
ModelDescription: アウトプットファイルに記される記述．まあ無くても問題はないだろう．
Choice: 選択モデルなのでCHOICEと入れておく．
beta: 推定するパラメータについて記述する．左から順に，パラメータ名，初期値，下限，上限，パラメータを推定するか固定するかのフラグ．
LaTeX: biogemeでは，アウトプットファイルの中に.texファイルも生成されるのだが，その際に使用されるLATEXの構文．必要がなければ削除可能．
Utilities: 効用関数を記載する．左からID，名称，利用可能性(通常，1なら利用可能，0なら利用不可とする)，効用関数の記述．
Expressions: 上記で使用する変数の記述．右辺には，datファイルと同じように記述する．
Exclude: 除外するデータの記述．falseは0でtrueは1(以上)となるから，この例では，PURPOSEが1でも3でもないか，CHOICEが0であるものを示す．
Model: 推定に用いるモデルを記述．今回は多肢選択ロジットモデルであるから，MNLである．他のモデルだったらbinary probitならBP，nested logitならNLなど．
他にもいろいろ組み込めるらしい．詳しくはこちらのdocumentから．
実行
まず，modとdatの2種類のファイルを用意．
ファイルを選択，Estimateでパラメータ推定を実行．
実行後
Display fileから結果を表示できる．
これと同じ内容がhtmlやtexとして保存される．
.resはSimulateをする際に使うモデルファイル．
モデルを用いて推計する
次の段階として，ここで得たモデルを使って推計したい，という場合．
上記のパラメータ推定で生成された，推定したパラメータが組み込まれたモデルファイル.resを，.modの拡張子に変え，用いるデータ.datとこのモデルファイルを選択してSimulateすれば.enuファイルとして推計結果が出力される．
おわりに
まあ，英語がわかるなら公式サイトを見ればよいと思いました(小並感)