結論

アプリケーション設定より、 WEBSITE_LOAD_USER_PROFILE = 1 と設定しましょう。
設定しない場合、下記のようなエラーメッセージが出力され、インスタンス作成に失敗する可能性があります。

Exception calling ".ctor" with "3" argument(s): "The system cannot find the file specified.

※ この記事は Microsoft Azure Tech Advent Calendar 2021 の 15 日目の記事です。

事象

例えば、 Azure Key Vault から証明書情報を読み込み、 X509Certificate2 クラスを作成するような Azure Functions の関数があったとします。
アプリケーション設定で WEBSITE_LOAD_USER_PROFILE = 1 を設定していない場合、関数を実行すると下記のエラーが発生してしまう場合があります。

Exception calling ".ctor" with "3" argument(s): "The system cannot find the file specified.

エラーメッセージから見ると、引数の証明書情報に不備があるように見えますが、 WEBSITE_LOAD_USER_PROFILE = 1 が設定されていない場合の Azure Functions (App Service) の想定された挙動となりますのでお気を付けください。

サンプル

関数の実行環境として Powershell を選択した場合のサンプルコードは下記のようなものです。
内容はシンプルで Azure Key Vault から証明書の情報を取得し、それに基づいてX509Certificate2 クラスを作成するというものです。

$containerName = '<キーコンテナ名>'

$certName = '<証明書名>'

$certificate = Get-AzKeyVaultCertificate -VaultName $containerName -Name $certName

$secret = Get-AzKeyVaultSecret -VaultName $vaultName -Name $certificate.Name

$secretText = '';

$ptr = [System.Runtime.InteropServices.Marshal]::SecureStringToBSTR($secret.SecretValue)

try {

    $secretValueText = [System.Runtime.InteropServices.Marshal]::PtrToStringBSTR($ptr)

}

finally {

    [System.Runtime.InteropServices.Marshal]::ZeroFreeBSTR($ssPtr)

}

$secretByte = [Convert]::FromBase64String($secretText)

$Certificate = New-Object System.Security.Cryptography.X509Certificates.X509Certificate2($secretByte, '', 'Exportable,PersistKeySet')

なお、上記テストコードを実行する際には Get-AzKeyVaultCertificate Get-AzKeyVaultSecret コマンドを利用できるよう、依存関係を追加する必要があります。
下記のドキュメントを参考に host.json および requirements.psd1 を編集してください。

Azure Functions の PowerShell 開発者向けリファレンス | Microsoft Docs

なお、 host.json はデフォルトでmanagedDependency プロパティが true になっています。
また、requirements.psd1 はデフォルトで Az コマンドがコメントアウトされているので、コメントインすれば OK です。
Azure ポータルから、[アプリファイル] から編集可能です (画像はコメントイン後)。

依存関係の追加後、 Azure Functions を再起動しましょう。再起動後、追加された依存関係のダウンロードが開始されます。

※上記サンプルは KeyVault にアクセスする際に必要な認証情報は省略しております。
手軽に設定したい場合は Functions にマネージド ID を付与する方法が簡単です。

ID ブレードからシステム割り当てマネージド ID をオンに
KeyVault 側でアクセスポリシーブレードより 1 で登録したマネージド ID に対してアクセス許可を付与する
関数コード冒頭に Connect-AzAccount -Identity を追加する

実行結果

依存関係を追加して再起動後、上記の関数コードを実行し、結果を[モニター]より確認するとエラーが発生していることがわかります。

原因

WEBSITE_LOAD_USER_PROFILE = 1 が設定されていない場合、 Functions(App Service) ホストはユーザープロファイルおよびその配下の証明書ストアの情報をロードしません。
しかし、 X509Certificate2 クラスのコンストラクタはユーザープロファイル内から証明書情報をインポートしようとします。
その結果、上述のエラーが発生した、ということになります。

ちなみに下記の記事にある通り、 X509Certificate2 クラスを作成した際に作成される証明書情報はデフォルトでは X509KeyStorageFlags.UserKeySet が設定されているためユーザープロファイル内の証明書ストアに保存されます。

[Seven tips for working with X.509 certificates in .NET]
(https://paulstovell.com/x509certificate2/)

まとめ

Azure Functions (App Service) 上で X509Certificate2 クラスを作成するときには、アプリケーション設定よりWEBSITE_LOAD_USER_PROFILE = 1 を設定すると、不可解なエラーに遭遇せず済む場合がありますので、ご検討ください。
局所的な内容となってしまいましたが、こちらの記事がエラーで困っているどなたかの助けとなればと思います。

参考文献