要件

という~~絶望的な~~制約の中でIN句を動的に設定する必要が出てきました。
なお当方にストアドプロシージャの知識はありません。

解決策

SQLServerならSTRING_SPLITに文字列と区切り文字を渡せばサブクエリとしてIN句の条件に使えます。(参考)

select
  id,
  name
from
  employee
where
  id in (
    select
      value
    from
      STRING_SPLIT('001,002,003', ',')
  )

ORマッパー使えないのはキツいけど製品の制約なのでどうしようもないのですが、この場合は正直言って素直にストアドプロシージャ使った方が良いような気がします。