SOのやり取りを見ている中で、「Don't print size_t with the %d format specifier, it invokes undefined behavior」という記載があった。 知らなかった。
元々の質問では以下のような部分で%zuでなく%dを使っていたのだろう。
printf("oneInt=%zu\n",sizeof(struct oneInt));
また、%zuでなく%uの場合の問題としては、64bit machineでコンパイル時に警告がでるとのこと
SO: How to print size_t variable portably?
32bit, 64bitで共通のコードとする場合は%zuを使っておく方が無難であるようだ。
長さ修飾子zはC99から導入されたようだ Wikipedia