動作環境
Xeon E5-2620 v4 (8コア) x 2
32GB RAM
CentOS 6.8 (64bit)
openmpi-1.8.x86_64 とその-devel
mpich.x86_64 3.1-5.el6とその-devel
gcc version 4.4.7 (とgfortran)
WRF(Weather Research and Forecasting Model)関連。
WRFの処理をOpen MPIとMPICHで比べてみた。
対象としたケースは
http://www2.mmm.ucar.edu/wrf/OnLineTutorial/CASES/index.html
の
Default January 2000 case
Open MPI
wrf.exe実行時にtime mpirun -np 6 ./wrf.exeのようにして処理時間を見てみた。
秒未満の時間は「切り捨て」た。
| np | real | user |
|---|---|---|
| 1 | 2m7s | 2m3s |
| 3 | 0m46s | 2m15s |
| 6 | 0m28s | 2m50s |
| 16 | 0m17s | 4m26s |
なぜかnp=16のuserがやたら大きい。
MPICH
| np | real | user |
|---|---|---|
| 1 | 2m6s | 2m3s |
| 3 | 0m45s | 2m16s |
| 6 | 0m28s | 2m51s |
| 16 | 0m23s | 6m11s |
np=16のuser以外はOpen MPIと同様の結果となった。