動作環境

Windows 7 Pro (32bit)
Sublime Text 3 Build 3143
   - ConvertToUTF8インストール済

Shift-JISの多量のソースファイルを閲覧している。

上記の処理をしている過程にて、サイドバーの選択とタブで開くファイルのずれが発生する。

手順3のエンコーディング選択でのキーの入力がサイドバーの現在位置に加わっているのかもしれない。

ずれは必ず発生するというわけではない。条件は未消化。

Close All Filesでいったんすべてのタブを閉じる。
再度、上から順番にタブを開いていき、「エンコーディング未確認のすべてのファイル」に対して、エンコーディングを確定すれば、ずれは発生しなくなるだろう。