わずらわしいですよね. あれ. 表題の件.

で, 解決策は Signing & Capabilities で Signing をきちんと指定してあげるだけ.
なんですが, oFだとPG使いますよね. PG使うとそこらへんの設定吹き飛んじゃいますよね.

ということでちょっと一手間加えてレトルト食品を美味しく変身させちゃおうっていう.

scripts/templates/osx/Project.xcconfig の最後に

// #include? "./UserDefined.xcconfig"
#include? "./App.xcconfig"

を追加. ~~ファイル名は好きなものに変えても良いです.~~

で, プロジェクトディレクトリに ~~UserDefined.xcconfig~~ App.xcconfig を作成して次のような内容を記入.

CODE_SIGN_STYLE = Automatic
DEVELOPMENT_TEAM = XXXXXXXXXX
CODE_SIGN_IDENTITY = Apple Development

DEVELOPMENT_TEAM は https://developer.apple.com/account#MembershipDetailsCard 辺りで確認してください.

以上.

追記:
UserDefined.xcconfig という名称で書きましたが次期バージョンからは同じ意味のファイルとして App.xcconfig がデフォルトで追加されます.
ので, 今から App.xcconfig にしておくと幸せになれそうですね.