環境

macOS Big Sur バージョン11.0.1
Homebrew 2.5.12
nodebrew 1.0.1

問題となっている状況

$ brew doctor

Warning: Unbrewed header files were found in /usr/local/include.
If you didn't put them there on purpose they could cause problems when
building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

Unexpected header files:
  /usr/local/include/node/js_native_api.h
  /usr/local/include/node/js_native_api_types.h
  /usr/local/include/node/libplatform/libplatform-export.h
  /usr/local/include/node/libplatform/libplatform.h
  /usr/local/include/node/libplatform/v8-tracing.h
  /usr/local/include/node/node.h
  /usr/local/include/node/node_api.h
  /usr/local/include/node/node_api_types.h
  /usr/local/include/node/node_buffer.h
  /usr/local/include/node/node_object_wrap.h
  /usr/local/include/node/node_version.h
  /usr/local/include/node/openssl/aes.h
  /usr/local/include/node/openssl/archs/BSD-x86/asm/crypto/buildinf.h
  /usr/local/include/node/openssl/archs/BSD-x86/asm/crypto/include/internal/bn_conf.h
  /usr/local/include/node/openssl/archs/BSD-x86/asm/crypto/include/internal/dso_conf.h
  /usr/local/include/node/openssl/archs/BSD-x86/asm/include/openssl/opensslconf.h

　.....予期しないヘッダーファイルの羅列.....

原因

homebrewを使わずにnode.jsを導入したため。
具体的には、DockerでWordPress開発環境構築のためnode.jsをインストールしていたが、homebrewからnodebrewを導入しnodeの安定版をインストールした。

実行したこと

問題となっているフォルダごと削除
パスワードを求められるので入力して実行

$ sudo rm -R /usr/local/include/node

brew doctor で確認

Unexpected header files が全てクリアになり解決しました。

参考

brew doctor したらUnbrewed header files were found in /usr/local/include. と言われたから消そうとしたけど消せなかった話