前提条件・必要なもの

母艦がWindows(64bit)の場合について書きます。
Intel Edison 本体
Intel Edison Mini breakout board または Arduino Board
MicroUSBケーブル×2本
※手順中で指示されるまでEdisonをPCにつながないこと！

セットアップツールのインストール

下記からセットアップツール(InstallersのWindows64bit)をダウンロードし実行する
https://software.intel.com/iot/hardware/edison/downloads

#ドライバーインストール
ライセンス条項への同意や内容確認を進めていくと、下の画面にたどり着く

「Install Drivers>」をクリック。すると画面が遷移する。

この画面で「Next」をクリックすれば、ドライバーのインストールが始まる。
途中、別ウィンドウでライセンス同意やインストールの確認が求められるが、
全て「はい」でよい。

#Intel Edisonへのファームウェア書き込み
次の画面で、「Flash Firmware>」をクリック

Firmwareのダウンロード先を聞かれるので、そのまま「Next>」をクリック

ダウンロードサイズの確認画面の次で、ダウンロードが行われる。
Firmwareのダウンロードが終わると、Intel Edisonを接続するように指示されるので
それに従う。順番を間違えると認識しないので注意。

いくらやっても「Next」ボタンが押せない、途中でエラーが発生する場合は
別の方法を試してみてください。
書き込みが終了すると、下記二つが選択できるようになる。

#SSH有効化
Intel Edisonの識別名、ログインする際のrootユーザーのパスワードを設定する。

#WiFi接続設定
WiFiの接続設定を行う。
なお、この画面では固定IPにはできない。
IPアドレスを固定する場合は、別途設定する。

参考資料