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なんでもかんでもJupyter Notebookに表示するためのチートシート 2次元プロット編

Last updated at Posted at 2017-01-27

NumPyのndarrayから2次元グラフ

準備するデータはこれ

Notebook
import numpy as np

x = np.linspace(0, 10)
y1 = np.sin(x)
y2 = np.cos(x) * 2

Matplotlib

Notebook
import matplotlib.pyplot as plt
# Notebook出力には次の1行が必要
%matplotlib inline
                            
plt.figure(figsize=(8, 6))    # グラフのサイズ指定(この行は省略可)
plt.plot(x, y1)
plt.plot(x, y2)

output_1_1.png


Bokeh

bokeh.plottingモジュールの場合

Notebook
from bokeh.plotting import output_notebook, figure, show
output_notebook()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

fig = figure(width = 600, height=400)    # width, heightは省略可
fig.line(x, y1)
fig.line(x, y2)
show(fig)
スクリーンショット 2017-01-28 17.51.46.png

Matplotlibに近い感じで覚えやすいけど、色を個別に指定する必要があるのが面倒。
公式ドキュメント:Plotting with Basic Glyphs


bokeh.chartsモジュールの場合

Notebook
from bokeh.charts import output_notebook, Line, show
output_notebook()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

chart = Line(data={'x': x, 'y1': y1, 'y2': y2}, x='x',
             width=600, height=400)    # width, heightは省略可
show(chart)
スクリーンショット 2017-01-28 17.55.39.png

単純なデータを素早くプロットするには向いていないけど、自動的に軸ラベルやレジェンドが入ったりと気が利いている。
公式ドキュメント:Making High-level Charts


MatplotlibからにBokehに変換

notebook
import matplotlib.pyplot as plt
from bokeh.plotting import output_notebook, show
from bokeh.mpl import to_bokeh
output_notebook()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

plt.plot(x, y1)
plt.plot(x, y2)
show(to_bokeh())
スクリーンショット 2017-02-02 23.49.33.png

公式ドキュメント:Leveraging Other Libraries


Plotly

グラフのサイズを指定しない場合

Notebook
from plotly.graph_objs import Scatter
from plotly.offline import init_notebook_mode, iplot
init_notebook_mode()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

scatter1 = Scatter(x=x, y=y1)
scatter2 = Scatter(x=x, y=y2)
iplot([scatter1, scatter2])    # <- Notebookに出力するにはiplot関数を使う
スクリーンショット 2017-02-02 23.40.48.png

公式ドキュメント:Plotly Offline for IPython Notebooks


グラフのサイズを指定する場合

Notebook
from plotly.graph_objs import Scatter, Figure, Layout
from plotly.offline import init_notebook_mode, iplot
init_notebook_mode()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

scatter1 = Scatter(x=x, y=y1)
scatter2 = Scatter(x=x, y=y2)
fig = Figure(data=[scatter1, scatter2], layout=Layout(width=600, height=400))
iplot(fig)    # <- Notebookに出力するにはiplot関数を使う
スクリーンショット 2017-02-02 23.44.25.png

公式ドキュメント:Python Setting Graph Size


MatplotlibからPlotlyに変換

Notebook
import matplotlib.pyplot as plt
from plotly.offline import init_notebook_mode, iplot_mpl
init_notebook_mode()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

plt.plot(x, y1)
plt.plot(x, y2)
iplot_mpl(plt.gcf())    # <- MatplotlibのグラフをNotebookに出力するにはiplot_mpl関数を使う
スクリーンショット 2017-02-02 23.50.29.png

pandasのDataFrameから散布図

Bokehのライブラリに最初からDataFrameになっているサンプルデータが含まれているのでそれを使ってプロットする。

Notebook
from bokeh.sampledata import iris
df = iris.flowers
df.head()
スクリーンショット 2017-02-10 8.04.53.png

Matplotlib

Notebook
import matplotlib.pyplot as plt
# Notebook出力には次の1行が必要
%matplotlib inline

plt.scatter(df['sepal_length'], df['sepal_width'])

Matplotlib散布図.png


Bokeh

Notebook
from bokeh.charts import output_notebook, Scatter, show
output_notebook()    # <- Notebook出力にはこの1行が必要

chart = Scatter(data=df, x='sepal_length', y='sepal_width',
                width=600, height=400)      # width, heightは省略可
show(chart)
スクリーンショット 2017-02-10 8.01.39.png

公式ドキュメント:Making High-level Charts - Scatter Plots


pandas

Notebook
import matplotlib.pyplot as plt
# Notebook出力には次の1行が必要
%matplotlib inline

df.plot.scatter(x='sepal_length', y='sepal_width')

pandas散布図.png


seaborn

Notebook
import seaborn
# Notebook出力には次の1行が必要
%matplotlib inline

seaborn.jointplot(x='sepal_length', y='sepal_width', data=df)

seaborn散布図.png

参考リンク:

Pythonの可視化パッケージの使い分け - Qiita
なんでもかんでもJupyter Notebookに表示するためのチートシート 3次元プロット編 - Qiita

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