modalPresentationStyleを.OverCurrentContextにしてモーダルを表示して消す際にcompleteTransitionを呼ぶと何故か呼び出し元のビューコントローラのビューが吹き飛ぶ

                    fromViewController?.view.removeFromSuperview()
                    if let toView = toViewController?.view {
                        self.transitionContext!.completeTransition(true)
                        UIApplication.sharedApplication().keyWindow?.addSubview(toView)
                    }
                    self.transitionContext = nil

こうやってもう一回付けてあげればおｋ
key windowが動的に生成されてたりするとぶっ壊れる気がする。

ios - "From View Controller" disappears using UIViewControllerContextTransitioning - Stack Overflow

iOS8からのバグっぽい