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@natsu-re

numpyでヒストグラムを作る

問題

最も簡単なやり方はmatplotlibを使うことです。例えば、[Python]Matplotlibでヒストグラムを描画する方法

もしかしたらナンセンスかもしれないけど、numpyのnp.histogramからやりたかったのでここにメモする。np.histogramから値を取ってくるには、

hist, bins = np.histgram(data)

のようにすればいいけれど、binsにはbinの両端の値が入っていて、だから

plt.bar(bins, hist)
plt.show()

とやっても、配列の長さが一致していないと怒られる。どうしたらいいのだろうか。

方法

binsの値の代わりにbinの中央値の値を吐き出す関数を書けば良い。以下のコードを書いた。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

def hist(arr, nbins=10, weights=None, isNormed=False):
    """
    Args:
        arr: 1d array
        bins: the number of bins
    Returns:
        hist: 1d array, histogram
        bins[:-1]: 1d array, centers of bins
    """
    hist, bins = np.histogram(arr, bins=nbins, weights=weights)
    if isNormed: hist = hist/hist.sum()
    halfDeltaBin = np.diff(bins)[0]/2
    bins = bins + halfDeltaBin
    return hist, bins[:-1]
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