CWLで特定のタグがついたテストだけ実行する

概要

特定のタグがついたものだけをテストしたいときの方法について。
状況としては、ワークフローやコマンドラインツールのうち、
バージョンをあげたものだけ、テストしたいなど。

まとめ

--tags で、指定すればよい。
いくつかテストを書いていて、そのなかの、 samtools だけをテストしたいなら
--tags samtools

$ cwltest --test cwltest.yml --tags samtools
Test [1/1] A test for samtools view
All tests passed
$

samtools と bwa の２つをテストしたいなら
--tags samtools,bwa で指定できる

$ cwltest --test cwltest.yml --tags samtools,bwa
Test [1/2] A test for bwa mem
Test [2/2] A test for samtools view
All tests passed
$