表題の際には以下の正規表現パターンを使えばいいと気づいた。
http://ref.xaio.jp/ruby/classes/string/gsub
Ruby 1.9では、パターンの中で(?<名前>パターン)という形でカッコに名前を付けられます。
第2引数replacementの中では、\k<名前>という書式でそのカッコに当てはまる部分を埋め込めます。
s = "one two, three four, five six"
puts s.gsub(/(?<first>\w+)\s+(?<second>\w+)/, '\k<second> \k<first>')
two one, four three, six five