e.preventDefault()でマウススクロールイベントが無効になってしまったので、以下で対処した。
hogeというブロック要素のスクロールを有効に。
//マウススクロールイベント
var scrollPosition = 0;
$('#hoge').on('mousewheel', function(e) {
//マウススクロールした回転量を取得
var delta = e.originalEvent.deltaY ? -(e.originalEvent.deltaY) : e.originalEvent.wheelDelta ? e.originalEvent.wheelDelta : -(e.originalEvent.detail);
//対象要素の非表示領域を含めた縦幅を取得
height = $('#hoge').get(0).scrollHeight;
scrollPosition = scrollPosition-delta;
if (scrollPosition < 0) {
scrollPosition = 0
}
if (scrollPosition > height) {
scrollPosition = height;
};
$('#hoge').scrollTop(scrollPosition);
});