/rootdir/
+ /subdir/ (←ここにconcrete5をインストール)

http {

    server {
        root         /var/www/html;

        location / {
            index  index.html;
        }

# サブディレクトリにアクセスがあった際に index.php をURLから除外する設定
        location /subdir {
            index  index.php;
            if (!-e $request_filename) {
            rewrite ^/subdir/ /subdir/index.php last; 
            }
        }   

# サブディレクトリにある 拡張子が .php ファイルを php-fpm に処理を回す設定
        location ~ ^/subdir/\.php($|/)  {
             include       fastcgi_params;
             fastcgi_pass  127.0.0.1:9000;
             fastcgi_index index.php;
             fastcgi_param URI $uri;
             fastcgi_param SERVER_NAME $host;
             fastcgi_param REQUEST_METHOD $request_method;
             fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
             fastcgi_read_timeout 30;
        }

    }
}