Mavericksにupdate後、Keynoteを6.0にすると従来の方法( Keynoteで作成した図をコピーしてToyViewerでepsを作成 http://sogensou.mulabo.org/memo/keynotedezuochengshitatuwoepsnibianhuansurufangfa )ができません。
その他、ImageMagick等のコンバートも、私の環境ではうまくいきませんでした。
調べた所、Keynote 6.0は、eps形式に対応しなくなっているようで( https://discussions.apple.com/message/23539099?tstart=0#23539099?tstart=0 )、この影響で、正常な出力ができなくなっているようです。
現状、Keynote 6.0での解決策は見つからないので、Applications内のiWorksフォルダから旧バージョンを開き、epsを作る方法しかなさそうです。
Keynote 6.0 にupdateしても、フォルダ内には、旧バージョンが残ったままですので、普通に使用できます。