ストーリーボード上でStoryboard IDを付けておく
ViewControllerのIdentity inspector
コード内でストーリーボードを生成し、IDで呼び出す
// MainStoryboard.storyboardの生成
let storyBoard: UIStoryboard = UIStoryboard(name: "MainStoryboard", bundle: nil)
// ここでID指定して自前のNavigationControllerクラスとして生成
var nav = storyBoard.instantiateViewControllerWithIdentifier("CommentNavigationController") as NavigationController
// パラメータ渡したいのでNavigationControllerの中身のviewControllerを生成
let topView = nav.topViewController as CommentViewController
// プロパティに渡す
topView.parameter = hoge