Rails+Passengerを使って、サブディレクトリにアプリケーションを公開し、そこでActiveAdminを動かしている際、メニューなどのリンク先が全部ルートディレクトリからのパスになってしまい、正常に遷移できなくなってしまう場合があります。
その際はconfigのどこかに以下の定義をします。(サンプルはmy_app以下に公開する場合)
Rails.application.routes.default_url_options[:script_name] = '/my_app'
ActiveAdmin以外への影響もないようです。
参考: Navigation URLs aren't generated correctly when using Passenger's RackBaseURI