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GAMESS

Python 2 > 実装 > 特定の文字列の { 先頭の空白を消す | Markdownヘッダ(###)を付加する } | sedでファイルの中身が消える例

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動作環境
Xeon E5-2620 v4 (8コア) x 2
32GB RAM
CentOS 6.8 (64bit)
openmpi-1.8.x86_64 とその-devel
mpich.x86_64 3.1-5.el6とその-devel
gcc version 4.4.7 (とgfortran)
NCAR Command Language Version 6.3.0
WRF v3.7.1を使用。
Python 2.6.6 (r266:84292, Aug 18 2016, 15:13:37) 
Python 3.6.0 on virtualenv

関連: GAMESS > 出力ファイルの項目

仕様

特定の文字の前に複数個の空白が入っているとする。

$ cat sample.in 
   A B C
  D E F
G    H I

上記の形式を以下に変換したい。

$ cat sample.md 
###A B C
###D E F
###G    H I

code

toMarkdown_170829.py
from __future__ import absolute_import
from __future__ import division
from __future__ import print_function
import subprocess
import sys

# On Python 2.6.6

# coding rule:PEP8

# { Configuration----
# Set strings' lists for GAMESS output
targets = ("A B C",
           "D E F",
           "G    H I"
           )
# } Configuration----

if len(sys.argv) < 3:
    print('ERROR: invalid runtime parameter')
    print('\ntype:')
    print('python %s [input file] [output file]' % sys.argv[0])
    sys.exit()

IN_FILE = sys.argv[1]
OUT_FILE = sys.argv[2]
WRK_FILE = 'wrk.md'

for elem in targets:
    # 1. replace
    cmd = "sed 's/ *%s/###%s/g' %s > %s" % (
        elem, elem, IN_FILE, WRK_FILE)
    # print(cmd)  # for debug
    subprocess.call(cmd, shell=True)
    # 2. move
    # because (sed 's/A/B/g' in > in) will delete [in] file
    cmd = 'mv %s %s' % (WRK_FILE, OUT_FILE)
    subprocess.call(cmd, shell=True)

    # sys.exit()  # for debug
    IN_FILE = OUT_FILE

run
$ python toMarkdown_170829.py sample.in sample.md

sedで気づいた点

sed 's/A/B/g' out.md > out.mdを実行するとout.mdの中身が消える。
そのため、上記の実装では一時ファイル[WRK_FILE]を使用している。

参考