普通に管理するよりも何かしら見やすいインターフェースを使った方が便利なので比較。
GitHub
多数のサービスと連携できるので便利。数百単位でプライベートリポジトリを持ちたい場合は下記オープンソースのものを使った方がいいかも。Gitorious
多機能であるのにも関わらず、オープンソースで利用できる。きれいで使いやすいインターフェース、GitHubでいうところの PUll Request に当たる Merge Request 機能まである。チームごとにメンバーやできたり、プロジェクトごとにリポジトリを管理できるので、大きな組織で使いたい場合に良い。Issues はない。インストールはかなり面倒。GitLab
最近公開されたオープンソースのインターフェース。かなり良くまとまっている。Gitorious ほど大きくないのでインストールもそこまで難しくない（と思う）。コミットも多いので、これから使うならこれがいいかも。BitBucket
無料プランでもプライベートリポジトリを無制限に作ることができる。普段、GitHub上で活動しているとあまりこちらに行かなくなるので、正直あまり使わない。