先日の Anniversary Update で Insider Preview 以外にも bash が入るようになりましたが、Jupyter は起動こそするものの notebook を使おうとするとカーネルが落ちるという問題がありました。
何とかならないかなーと思っていろいろ調べてみたら、aseering という方が作ったパッチを当てたら何とかなりました。
notebook で使用される環境に対して、以下のコマンドを実行すればパッチが入ります。
$ conda install -c jzuhone zeromq=4.1.dev0
python のバージョンごとに環境を分けているなら、こんな感じですね。
$ source activate py35
(py35) $ conda install -c jzuhone zeromq=4.1.dev0
参考: https://github.com/Microsoft/BashOnWindows/issues/185
同じページに pip のパッチもあるようなので、 conda を使っていない方はそれを使えば何とかなるかもしれません。