>>> import scipy
>>> scipy.__version__
'0.19.1'
>>> from scipy.sparse import csr_matrix
>>> A1 = csr_matrix([[1,2],[2,3],[3,4]])
>>> A2 = csr_matrix([[1,2],[2,3],[3,4]])
>>> B = csr_matrix([[1,2],[3,4],[5,6]])

A1 - A2の非ゼロの要素数が0になるかを確認する。

# equal
>>> A1 - A2
<3x2 sparse matrix of type '<class 'numpy.int64'>'
        with 0 stored elements in Compressed Sparse Row format>
>>> (A1 - A2).nnz == 0
True
# not equal
>>> A1 - B
<3x2 sparse matrix of type '<class 'numpy.int64'>'
        with 4 stored elements in Compressed Sparse Row format>
>>> (A1 - B).nnz == 0
False

A1 != A2の非ゼロの要素数が0になるかによっても確認できる。

# equal
>>> A1 != A2
<3x2 sparse matrix of type '<class 'numpy.bool_'>'
        with 0 stored elements in Compressed Sparse Row format>
>>> (A1 != A2).nnz == 0
True
# not equal
>>> A1 != B
<3x2 sparse matrix of type '<class 'numpy.bool_'>'
        with 4 stored elements in Compressed Sparse Row format>
>>> (A1 != B).nnz == 0
False

scipy.sparse.coo_matrixやscipy.sparse.csc_matixでも同様の比較方法が使える。

scipy.sparse.csr_matrixのオブジェクトの内容が同じか比較する方法

参考