Windowsのシステム環境変数とユーザ環境変数

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環境変数の適用

どちらか片方のみが設定されている場合

設定された値が呼び出される。

両方に設定されている場合

ユーザ環境変数で上書される。
※PATHだけは例外

PATHが両方に設定されている場合

「システム環境変数;ユーザ環境変数」という形で設定される。
後ろに追加されるというのがミソで、「%JAVA_HOME%\bin」などをユーザ環境変数に設定しても「C:\WINDOWS\system32」などにjavaがあったりするとこちらが優先して使われます。

ユーザ毎にPATHを上書きする方法ってあるんですかね?

サービスで起動されたアプリケーションの環境変数

通常は「システム環境変数」のみ適用される。
サービスの設定の「ログオンタブ → アカウント」でサービス起動ユーザを指定すると、ユーザ環境変数が反映される。

参考URL

http://d.hatena.ne.jp/takuya_1st/20110116/1295188903