コミットメッセージ中の行頭や行末の空白を git commit の際に削除してくれるオプションである
$ git config --global commit.cleanup whitespace
を設定するとコミット時の#から始まる行が無視されなくなります。
おそらくこの機能に対応していないバージョンであろう1.7.11.3だと下記のように表示されます
# Please enter the commit message for your changes. Lines starting
# with '#' will be ignored, and an empty message aborts the commit.
# On branch master
# Changes to be committed:
# (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)
#
#>......modified: Readme.md
#
1.8.2だと下記のように表示されます。
# Please enter the commit message for your changes. Lines starting
# with '#' will be kept; you may remove them yourself if you want to.
# An empty message aborts the commit.
# On branch master
# Changes to be committed:
# (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)
#
#>......modified: Readme.md
#
この挙動が気に入らない場合は設定を削除するか、commit.cleanup = strip
とする必要があります。