CaffeをOSX10.11にmacports+anacondaでインストール

Caffe on OSX10.11 with macports+anaconda

CaffeをAirMacにインストール．GPUはないのでCPUモードのみ．
検索したところ，homebrewの情報は見つかっても
macports+anacondaの組み合わせの情報は見つからなかったので，
参考までにメモ．

注意：結局うまくいかず．anacondaのpythonが参照するライブラリとmacportsのpythonが参照するライブラリが競合してだめ．anacondaを使わずにmacportsだけならうまくいく.
macportsでcaffe for OSX10.11を参照．

install

anaconda

Anaconda-2.3.0-MacOSX-x86_64.pkgを$(HOME)/anacondaにインストール．
（これはpython27用）

condaでパッケージのインストール

conda install boost cython numpy scipy scikit-image matplotlib ipython h5py networkx nose pandas python-dateutil protobuf python-gflags pyyaml pillow six

condaにleveldbがないのでpipでインストール

condaのpipでインストール

pip install leveldb

macports

MacPorts-2.3.4-10.11-ElCapitan.pkgを/opt/local/にインストール．

macportsでパッケージのインストール

port install boost +python27
port install opencv +python27 +eigen
port install boost protobuf-c protobuf-cpp google-glog gflags hdf5 leveldb snappy lmdb 

caffe

git clone https://github.com/BVLC/caffe.git
cd caffe
cp Makefile.config.example Makefile.config

ここでMakefile.configを書き換え．

Makefile.configの変更点

CPU_ONLY := 1 # airmacなので

BLAS := atlas # 簡単にベタなatlas

# home以下にanacondaをいれたので
ANACONDA_HOME := $(HOME)/anaconda
PYTHON_INCLUDE := $(ANACONDA_HOME)/include \
		 $(ANACONDA_HOME)/include/python2.7 \
		 $(ANACONDA_HOME)/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include \
PYTHON_LIB := $(ANACONDA_HOME)/lib

# macportsのライブラリは/opt/local/にあるのでそれを先に
INCLUDE_DIRS := /opt/local/include $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
LIBRARY_DIRS := /opt/local/lib $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib

# opencvのリンクのために
USE_PKG_CONFIG := 1

それからmake．

make all
make test
make runtest

ハマったところ

最初はMakefile.configのLIBRARY_DIRSで/opt/local/libを$(PYTHON_LIB)の後に書いていた．

するといつまでもこのエラーが消えない．

エラーメッセージ

$ make runtest
.build_release/tools/caffe
dyld: Library not loaded: @rpath/./libhdf5.10.dylib
  Referenced from: /*********/caffe/.build_release/tools/caffe
  Reason: image not found
make: *** [runtest] Trace/BPT trap: 5

似たようなエラーが見つかるが

• PyCaffe import failing "Library not loaded ... Reason: image not found #2720
  役に立たず．

結局，anacondaのライブラリを先に読みに行っていたので，
macportsのhdf5を見つけられずに失敗していた．

macportsをanacondaよりも先にLIBRARY_DIRSに書けばOK．

その後：失敗

結局，pythonライブラリが競合してダメ．
import pycaffe in local Mac OS 10.9 reports "segmentation fault: 11" #591と同じ問題が生じる．
anacondaを使わずにmacportsだけならうまくいく.
macportsでcaffe for OSX10.11を参照．