Caffeは深層学習(特にビジョン系)で非常にパワフルなツールでありますが、たくさんの依存ライブラリがあり、インストールの段階で多くの初心者達が出鼻をくじかれると聞いております。特に、自分がroot権限を持っていないクラスタマシン等でのインストールにおいては、1ヶ月やってもできなかった、なんて言う人がいるという伝説も聞いたことがあります。
ここでは、あくまで一例として僕自身が計算クラスタ環境でインストールしたときのメモを、少しでも皆様の参考になればと貼り付けておきます。
システムに元からインストールされているライブラリは環境によってまちまちだと思うので、上を参考にご自身で足りないライブラリをインストールしてみてください。