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mlpyをpython3.3(64bit)でビルド(windows 64bit)

Last updated at Posted at 2014-06-24

#mlpyをwindows 64bit環境でビルド
mlpyのwindows用バイナリは32bit用しか提供されないので、自力でビルドします
使用環境:

  • python3.3.5(64bit)
  • windows7 64bit sp1
  • Visual Studio 2010

#準備
必要なライブラリを入手

##numpy, scipyのインストール
mlpyを使おうとしているなら既にインストールされていると思います。
ない場合は、pip install numpy scipyでインストールしてください
##GSLのビルド
スタティックライブラリが必要になります。
私は半年以上前に別件でGSLをビルドしていたのですが、現在は状況が変わっているようです。
###以前
私がやった時は、以下のリンクを参考にしました。意外と簡単に出来ました。

###現在
現在では、visual studioのプロジェクトへのリンクが消滅しています。
バージョンが少し古いですが、gsl-1.15-vc10.zipを配布しているページは見つかりました。
また、All in Oneパッケージらしきもの(gnu-gsl-for-windows)がありました。
どちらも利用していないので、本当に利用可能かはわかりません。
※2014/7/3追記:gnu-gsl-for-windowsは予想通り使えました。

##mlpyの修正
64bit環境用にソースコードを修正します。

setup.pyの"win32""win-amd64"に変更。ただし、25行目はそのまま

before

setup.py(29-41行)
#### libs
if get_platform() == "win32":
   gsl_lib = ['gsl', 'cblas']
   math_lib = []
else:
   gsl_lib = ['gsl', 'gslcblas']
   math_lib = ['m']
   
#### Extra compile args
if get_platform() == "win32":
   extra_compile_args = []
else:
   extra_compile_args = ['-Wno-strict-prototypes']

after

setup.py(29-41行)
#### libs
if get_platform() == "win-amd64":
   gsl_lib = ['gsl', 'cblas']
   math_lib = []
else:
   gsl_lib = ['gsl', 'gslcblas']
   math_lib = ['m']
   
#### Extra compile args
if get_platform() == "win-amd64":
   extra_compile_args = []
else:
   extra_compile_args = ['-Wno-strict-prototypes']

コメントの2バイト文字を修正。Θと二重引用符(”)を削除

before

mlpy/fastcluster/fastcluster/src/fastcluster.cpp(630-632行)
    // Complexity: Θ(size)
    // Reference: Cormen, Leiserson, Rivest, Stein, Introduction to Algorithms,
    // 3rd ed., 2009, Section 6.3 “Building a heap”

after
コメントを削除

np.int_tnp.int64_tに変更

修正をしないとint型とlong long型の不一致による実行時エラーが発生してTutorialすら実行できません。
他にも修正が必要な個所があるかもしれませんが、今のところ発見できていません
before

mlpy/libsvm/libsvm.pyx(28-32行)
# array 1D to svm node
cdef svm_node *array1d_to_node(np.ndarray[np.float64_t, ndim=1] x):
    cdef int i, k
    cdef np.ndarray[np.int_t, ndim=1] nz
    cdef svm_node *ret

after

mlpy/libsvm/libsvm.pyx(28-32行)
# array 1D to svm node
cdef svm_node *array1d_to_node(np.ndarray[np.float64_t, ndim=1] x):
    cdef int i, k
    cdef np.ndarray[np.int64_t, ndim=1] nz
    cdef svm_node *ret

before

mlpy/adatron/adatron.pyx(69-73行)
        
        cdef np.ndarray[np.int_t, ndim=1] ynew
        cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=2] K_arr
        cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=1] alpha_arr
        cdef double margin

after

mlpy/adatron/adatron.pyx(69-73行)
        
        cdef np.ndarray[np.int64_t, ndim=1] ynew
        cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=2] K_arr
        cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=1] alpha_arr
        cdef double margin

##mlpyのビルド
お待たせしました
あとは

set LIB=%LIB%;(gsl.lib,cblas.libがあるディレクトリ)
python setup.py build_ext --include-dirs=(gslのインクルードディレクトリ)
python setup.py install

もしくは(anacondaをインストールした場合)
python setup.py build_ext --include-dirs=(gslのインクルードディレクトリ) --compiler=msvc install

で完了です。
お疲れ様でした。

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