コンテナが使用していないvolumeを削除するスクリプトもあるみたいなのですが、Macだと動かないので手動で整理することにしました。
jq入っていない場合インストール。
https://stedolan.github.io/jq/
docker ps -a --format "{{.Names}}" | xargs docker inspect | jq -r .[].Mounts[].Name | grep -v null
docker tool boxではなくてdocker for macを使っていますが特に関係ないと思います。
ここから、docker volume ls -q
との差分をとってdocker volume rm
で削除