AtomでサーバにファイルをSFTPでアップロードしたかったのでRemote-FTP設定しました。
手順1：Remote-FTPをインストールする
settings->+install で「Remote-FTP」を検索。install。
手順2：Remote-FTPの設定をする
Atomを再起動してからFTP設定したいプロジェクトを開いてから
パッケージ->Remote-FTP->Create SFTP config file
手順3：.ftpconfigファイルを書き換える
手順2をするとそれぞれのプロジェクトに.ftpcinfigができるので、書き換える。
パスワード認証を使わないときも行をまるまる消すのではなく""で空文字にしておく
手順4：接続してみる
パッケージ->Remote-FTP->Connect
手順5：設定変更してみる
atomのsettingsからRemote-FTPの設定を変更してみる。
「Auto Upload On Save」がデフォルトalwaysになっている。それだと常にローカルとサーバが同期してしまうのでneverに変更。
neverにしておくと、手動uploadした時だけ同期できる。
手順6：アップロードしてみる
更新したいファイルを右クリック->Upload
