Xcodeでプロビジョニングプロファイルを更新して追加する場合、これまでのプロビジョニングプロファイルとファイル名が異なり、同じidentifierのプロファイルが一覧に出ることがあります。
プロファイル自体は
~/Library/MobileDevice/Provisioning Profiles/
に配置されているのですが、ファイル名からidentifierが分からないため
にあるように、全てのプロファイルを一気に消している方も多いかと思います。
Xcode>Preference>Accounts>AppleIDs>View Details...>Provisioning Profiles
から、指定のidentifierのプロファイルを右クリックすると、Show in Finderを選ぶことができます。
追記
Xcode9.3からはプロファイルがquick lookで概要を見ることが出来るようになりました。
~/Library/MobileDevice/Provisioning Profiles/から不要なプロファイルを選択して消せるようになったとおもいます。