現象
#原因
想像ですが、ATOM1.2.0でCJK wrapが導入されたためと推測されます
ATOM 1.2
#対応方法
japanese-wrap を disabled にする。もしくはjapanese-wrap をアンインストールすることで折り返しが正しくなります。
ATOM 1.2からCJKのSoft Wrapが公式対応されたのでjapanese-wrapのパッケージが必要なくなりました。 - Qiita
にも書かれてました(汗
japanese-wrapの作者さまありがとうございました!