理解している人にとっては当たり前のことのような感じがするが、NOOBSでSDカードにRaspbianをインストールすると、Win32 Disk Imagerを使ってread/writeしても元通りにならない。
Raspbianをディスクイメージからインストールすると期待通りread/writeできる。
NOOBS使用時のパーティションの切り方が関係しているような気がするのだけれど、理由がちゃんと分かったらここに追記する。
2017/08/17 追記
以下のサイトをちゃんと読めば分かる気がする。
そして恐らくバックアップできないのではなくて、やり方が正しくない。
https://www.raspberrypi.org/forums/viewtopic.php?f=91&t=97003
https://www.raspberrypi.org/forums/viewtopic.php?f=29&t=75994