プルリクエストのマージ先ブランチを削除するとどうなるのか？

というのをやってみたところ、自動で Close された。

• プルリクエストのブランチは Open 後は変更できない
• マージ不可能なプルリクエストはCloseされる

マージする前にプルリクエストの変更と同じコミットを取り込んで、「マージしても何も変更は生じない」という状態の時にもこうなった記憶がある。

権限のないプルリクエストがOpenしているとブランチ削除ができない

さらに調べたところによると、中央→個人リポジトリで運用しているレポジトリでは、上記のよう推測される結果になった。

学びがありますね。