Git Shell立ち上げて、
> git config http.proxy = http://xxx.xxx.xxxx.xxx:port
でいけるようなことが書いてあるサイトがあったが、
> git config -l
しても、表示されないので、.gitconfigを直接弄る。
C:\Users\username
直下に、「.gitconfig」ファイルがあるはずなので、以下の様に追加。
[http]
proxy = http://xxx.xxx.xxx.xxx:port
これで、保存して、Github for Windowsを立ち上げれば、Proxy通して通信出来るはず。