ag-group-matches を nil にしたら解決しました。
M-x customize-variable RET ag-group-matches RET
ag のデフォルト出力が変わったんですかね?
--group の代わりに --nogroup が使われる様に、 ag-group-matches を nil にして対応した、というお話でした。
$ ag --version
ag version 0.32.0
Features:
+jit +lzma +zlib