タイトルのとおりです。
結論から言うと，rmarkdown::yaml_front_matter関数で取得できます。
面倒なので，以下の記事にあるyamlフロントマターを持ったファイル(yaml_front_matter_list.Rmd)があるとします(ファイルの内容は文末に記載):
R Markdownのhtml_documentで指定できるyamlヘッダ項目について - Qiita
これを上記の関数に通します:
yfm <- rmarkdown::yaml_front_matter("yaml_front_matter_list.Rmd")
str(yfm)
## List of 9
## $ title : chr "タイトル"
## $ subtitle : chr "サブタイトル"
## $ title-prefix: chr "タイトルプリフィックス"
## $ pagetitle : chr "ページタイトル"
## $ author : chr "オーサー"
## $ author-meta : chr "オーサーメタ"
## $ date : chr "2017/01/17"
## $ abstract : chr "このドキュメントのアブストラクト。"
## $ output :List of 1
## ..$ html_document:List of 25
## .. ..$ toc : logi FALSE
## .. ..$ toc_depth : int 2
## .. ..$ toc_float : logi FALSE
## .. ..$ number_sections : logi FALSE
## .. ..$ fig_width : int 7
## .. ..$ fig_height : int 5
## .. ..$ fig_retina : int 2
## .. ..$ fig_caption : logi TRUE
## .. ..$ dev : chr "png"
## .. ..$ df_print : chr "default"
## .. ..$ code_folding : chr "show"
## .. ..$ code_download : logi FALSE
## .. ..$ highlight : chr "default"
## .. ..$ mathjax : chr "default"
## .. ..$ smart : logi TRUE
## .. ..$ theme : chr "default"
## .. ..$ css : NULL
## .. ..$ templete : chr "default"
## .. ..$ include :List of 3
## .. .. ..$ :List of 1
## .. .. .. ..$ in_header: NULL
## .. .. ..$ :List of 1
## .. .. .. ..$ before_body: NULL
## .. .. ..$ :List of 1
## .. .. .. ..$ after_body: NULL
## .. ..$ extra_dependencies: NULL
## .. ..$ lib_dir : NULL
## .. ..$ md_extentions : NULL
## .. ..$ pandoc_args : NULL
## .. ..$ keep_md : logi FALSE
## .. ..$ self_contained : logi TRUE
こんな感じです。利用場面としては，自作テンプレなどでしょう。
Enjoy!
読み込ませたRmdファイル:
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title: "タイトル" #ページのタイトルで，h1要素としてbodyに入ります
subtitle: "サブタイトル" #ページのサブタイトルで，h1.titleのすぐ下にh2として入ります
title-prefix: "タイトルプリフィックス" #ウィンドウ上部枠に出てくるページ名タイトルの前に入ってきます
pagetitle: "ページタイトル" #ウィンドウ上部枠に出てくるページ名タイトルです
author: "オーサー" #著者で，複数名の時は'c("kosaki", "chitoge")'とすればOK
author-meta: "オーサーメタ" #head要素のmeta情報に書き込まれます
date: "2017/01/17" #日付です。決め打ちでもいいですし，rのコードでやる方法も
abstract: "このドキュメントのアブストラクト。" #本文のすぐ上にアブストラクトとして差し込まれます
output:
html_document:
# tocまわり
toc: FALSE #toc(table of contents)を自動生成するかどうか。論理値。
toc_depth: 2 #tocで拾う見出しレベルを指定。数値。
toc_float: FALSE #tocをページ冒頭ではなくサイドメニューとして浮かせて表示させるかどうか
number_sections: FALSE #見出しに通し番号をつけるかどうか
# figまわり
fig_width: 7 #図の大きさ。確かインチ
fig_height: 5 #図の高さ。確かインチ
fig_retina: 2 #retinaディスプレイに対応させていくかどうか
fig_caption: TRUE #図にキャプションを付与していくかどうか
dev: "png" #グラフィックデバイスを指定。この場合png形式。
# dfの処理
df_print: "default" #data.frameを表示させる際，kableとかtiblleとかpagedを指定。
# codeまわり
code_folding: "show" #デフォ値はc("none", "show", "hide") #デフォルトでRコード部分を表示させるかどうか。
code_download: FALSE #Rmdソースコードをhtmlに埋め込んでDLできるようにするかどうか。論理値。
highlight: "default" #シンタックスハイライトのテーマを指定。
# mathjax
mathjax: "default" #mathjaxをどう含めるか。
# テーマ・書式まわり
smart: TRUE #出力のタイポグラフィを変換するかどうか。ハイフンをem-dashesにするかなど。論理値。
theme: "default" #htmlのテーマを指定。NULLだとテーマ無し(プレーンなhtml)になる。
css: NULL #カスタムなcssを指定。
# ドキュメントまわり
templete: "default" #(Pandoc用)htmlテンプレートを指定。
include: #ドキュメントにhtmlを差し込むかどうか。
- in_header: NULL #<head>内に差し込む内容。htmlファイルを指定。通常はメタデータやjsコードなど
- before_body: NULL #<body>の一番最初に差し込む内容。htmlファイルを指定。通常はheader的な要素など
- after_body: NULL #<body>の一番最後に差し込む内容。htmlファイルを指定。通常はfooter的な要素など
# 拡張関連
extra_dependencies: NULL #新たに追加したいような要素や，拡張要素を指定。
lib_dir: NULL #jqueryとか依存するHTMLライブラリをコピーするディレクトリを指定。デフォは(ファイル名)_filesってディレクトリへ。
# 出力制御関連
md_extentions: NULL #Pandoc Markdown拡張で追加するand/or削除する要素を指定
pandoc_args: NULL #Pandocに送る引数を指定。
keep_md: FALSE #.mdファイルを残すかどうかを指定。論理値
self_contained: TRUE #jsやcss，画像データなどをbase64でhtmlファイルに埋め込み，単一ファイルにするかどうかを指定。論理値
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ほげほげ。