やっぱりシステムフォントを使いたいとなった時のコマンドです。
find . -type f -name "*.storyboard" -print0 | xargs -0 sed -i "" -e 's/name="HiraginoSans-W3" family="Hiragino Sans"/type="system"/g'
find . -type f -name "*.xib" -print0 | xargs -0 sed -i "" -e 's/name="HiraginoSans-W3" family="Hiragino Sans"/type="system"/g'
find . -type f -name "*.storyboard" -print0 | xargs -0 sed -i "" -e 's/name="HiraginoSans-W6" family="Hiragino Sans"/type="boldSystem"/g'
find . -type f -name "*.xib" -print0 | xargs -0 sed -i "" -e 's/name="HiraginoSans-W6" family="Hiragino Sans"/type="boldSystem"/g'
逆もまた然り